完全红熟的果实采收后不需后熟即可进行掏籽。方法是:用刀横割果实或用手掰开果实，挤出种子或用番茄脱离机脱离出种子。取出的种子周围会有部分果肉和胶冻状黏液，难以分离，需置于容器中进行酸化发酵。发酵工具可用木、陶、搪瓷、玻璃容器等。若种子量较大，简易的方法是用砖在平地上砌成一长方形发酵槽，其大小依种子多少而定，槽内地面整平、夯实。然后，在植内铺一张无裂缝、无孔洞的完整塑料薄膜，用于发酵。但不得使用铁器，否则会使种子颜色变差。
酸化发酵时，可将挤出的种子及其附带的部分果肉和胶状黏液一起放置于干净的发酵容器（槽）中，严防水分进入，并用塑料薄膜等防水布包盖严实，防治雨水淋湿。在酸化发酵中，如加入水或淋入雨水，种子颜色会变褐、变黑，甚至在发酵容器（槽）中就有部分种子发芽。此外，发酵时，容器（槽）内的液体体积会因发酵而膨胀。因此，容器（槽）不要装得过满，应距容器边缘有15-30厘米的距离，否则，会使发酵液溢出而造成种子流失。
发酵时间的长短与种子的色泽、发芽率均有密切关系。发酵时间过短，则胶冻不易与种子分离，洗出的种子稍带有粉红色，发酵时间过长，则种皮变黑，发芽率降低。发酵时间与发酵温度相关。通常在25℃-30℃下，发酵24 -36小时即可进行种子清洗。发酵的程度以浆液表面有白色菌膜覆盖、上面又无带色的菌落为宜。如表面没有白色菌落，则表明没有发酵好。但如白色菌膜上出现铁锈色、绿色或黑色菌落时，则表明浆液受细菌感染，多是发醉时间过长所致。发酵结束后，即可用木棒在发酵容器中搅动，使种子下沉与果胶分离，去掉容器(槽)上部污物，捞出种子，用水冲洗混杂在里边的果皮、果肉等杂物，漂出在水面的批籽，随时观察有无种子萌动
发芽现象，并注意清除。然后将沉在底部的好籽装入纱布袋中，挤出水分或放入离心机中甩干，发酵适度的种子应呈乳黄色，种子上有明显的茸毛.稍加揉搓种子便分开，而不粘连。经清洗的种子应立即进行干操处理。
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