无土栽培蔬菜采用新建的智能化调控温室，开始时植株健壮，但生产半年至1 年后，就会发现莴苣、小白菜、油菜、菠菜、黄瓜、甜瓜等均感染根腐病，根部腐烂，生长不良、矮化、萎凋死亡。
从理论上讲如能在无菌条件下进行无土蔬菜栽培，应该是无病害发生的。但生产上问题出在周围的环境不是无菌的，病原菌可来自水、种子、风、尘土、昆虫、操作人员等，为明确这个问题，在无土蔬菜栽培场正常运行2 个月之际，从根部没有分离到病原菌，然而2 个月后从窗户不锈钢网上搜集的风吹来的尘土中分离得到了腐霉菌，半年后即见此温室无土栽培蔬菜已染根腐病，病根在营养液中产生大量孢子囊和游动孢子，使邻株及同水槽中的健株染病，致植株矮化或死亡。
防治方法：
完善基础设施。蔬菜根腐病发生与否与采用的设施、培养方法、卫生管理措施等密切相关。栽培床最好选用封闭式且高于地面，贮液池要加盖，以防环境中的病菌侵入。营养液槽或工具可用酒精擦抹消毒，排液沟要保持畅通、严防病菌通过废液回流到栽培床中，造成重复侵染。
播种前种子要消毒。采用干热灭菌保持恒温70~72℃处理72 小时，也可用53~55℃温水浸种20~30 分钟，可有效地杀灭种子上的病菌。选用无土栽培法培育的菜苗，不仅定植时缓苗快，还可减少病菌侵染。
采用无土栽培需要多学科的知识和技术，尤其要注意选用适宜的农药品种及正确掌握使用方法，生产无公害蔬菜或有机蔬菜。
此外要注意加强卫生管理，保持营养液干净，地上铺碎石，温室外植草坪，禁止闲人入内，避免风吹尘土入内，工作人员要用消毒水清洗手脚，有条件的要常更换新鲜营养液，以避免液体流动，导致水传病害。
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