造成蔬菜黑皮烂秆的病害主要有菌核病、灰霉病、疫病和细菌性病害。黑皮烂秆是蔬菜在低温高湿季节经常发生的一种病害，严重时可造成发病部位以上枝叶萎蔫死亡，严重影响种植效益。有时候多种病害混合侵染，给防治带来了困难。
西红柿黑皮烂杆
一、菌核病
菌核病主要发生在距地面5厘米—22厘米茎部或茎分杈处，病斑绕茎一周后上下扩展，湿度大时，病部表面生有白色棉絮状菌丝体，后茎部皮层霉烂，髓部解体成碎屑，病茎表面或髓部形成黑色菌核。干燥时，植株表皮破裂，纤维束外露似麻状，个别出现灰褐色轮纹斑。
二、疫病
多在茎基部和枝杈处发病。发病初期为水浸状病斑，后出现环绕表皮扩展的褐色或黑褐色条斑，病斑处的皮层腐烂、缢缩，与周围健康组织分界明显。病部以上枝叶逐渐凋萎，田间湿度大时，严重时病部产生白色霉层。
三、灰霉病
幼茎染病，呈水渍状缢缩，变褐变细，造成幼苗折倒，高湿时生灰霉状物。成株茎和叶柄染病，病斑长椭圆形，初灰白色水渍状，后呈黄褐色，有时可见病处因失水而出现裂痕。
四、细菌性病害
细菌性髓部坏死
细菌性病害多从伤口处开始侵染，病部初呈水渍状暗绿色斑，后变褐软腐，腐烂后有臭味，不会产生霉层。如细菌性髓部坏死、细菌性软腐病、细菌性溃疡病等。
五、防治措施
1.调控棚室环境，降低湿度。
这四种病害都是由于低温高湿引起的，因此要想防治黑皮烂秆首先要创造不适宜病害发生的环境条件，即提高棚温，降低湿度。低温季节，为保证白天棚温，菜农可适当延迟通风时间，待棚内温度升到30℃左右时，方可通风降湿，下午2点以后如棚温下降，要及时关闭放风口，待棚温降至20℃左右时，放下草帘或保温被保温，保证夜间温度在12℃以上。
操作行铺设稻壳
2.通过铺设地膜、行间铺秸秆等措施也可有效降低棚内湿度。
为了降低湿度，增加植株间的通风透光性，菜农还应注意摘叶打杈，摘除烂果。对于灰霉病和菌核病，很重要的一点是要及时摘除残花残叶，拿到棚外深埋或烧毁，可减少病菌再次侵染的机会。
3.刮除病斑，涂抹药剂根据病害种类，选择合适的药剂。
如细菌性病害可以用噻唑锌、氯溴异氰尿酸、中生菌素等防治；疫病可以用霜霉威、甲霜灵、氟吗啉等防治；菌核病和灰霉病可以用啶酰菌胺混异菌脲等药剂防治。 通过叶面喷雾防治黑皮效果不佳时，可以进行药剂抹秆。涂抹前用小刀将病患处刮干净，涂抹时不要只涂抹伤口处，最好用毛笔或刷子将伤口周围也一并涂抹上，这样不仅对整个伤口进行了全面防治，对周围的部分也起到了防治效果。
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