微生物肥料是以微生物的生命活动导致作物得到特定肥料效应的一种制品，是农业生产中使用肥料的一种。而这些微小的生物是怎样在土壤中起作用的呢？
生物菌肥
微生物肥料的功效主要是与营养元素的来源和有效性有关，或与作物吸收营养、水分和抗病有关，概括起来有以下几个方面：
一、 培肥地力，这是微生物肥料的主要功效之一。
如各种自生、共生的固氮微生物，可以增加土壤中的氮素来源；多种解磷、解钾微生物的应用，可以将士壤中难溶的磷、钾分解出来，从而能为作物吸收利用。微生物菌肥施入土壤后，能快速繁殖并能形成活力强大的益生菌群，从根本上改善了土壤及根系周边的生态结构，使得多年使用化肥板结的土壤疏松透气，吸收空气中的氮并形成“生态氮肥” ，将多年沉积于土壤中的无效死磷死钾激活，让植物根系吸收。
二、增强抗逆性。
微生物肥料除了传统肥料的增产增收效果外，还可以减轻作物病害。这主要有以下三个方面的原因：
（一）是肥料中的有益微生物生长繁殖，在作物根际土壤微生态系统内形成优势种群，抑制其他有害微生物的生长繁殖，甚至对部分有害病原菌产生拮抗作用，减少了有害微生物的危害机会。
（二）是有益微生物在生长繁殖过程中向作物根际土壤微生态系统内分泌各种代谢产物，这些代谢产物能够刺激作物生长，提高作物抵抗不良环境的能力。
（三）是在植物受到病害、冻害、干旱、衰老等逆境时，施用微生物肥料其所含的菌种能诱导作物产生超氧化物歧化酶，消除因逆境而产生的自由基，从而提高作物的抗逆性，减轻病害。
生物菌肥
三、提高品质早熟高产。
微生物肥料能激发土壤中固定的钾、钙、锌等中微量营养元素。这些元素能供给作物微生物菌肥能产生植物激素类物质刺激作物生长。许多用作微生物肥料的微生物还可产生植物激素类物质，能刺激和调节作物生长，使植物生长健壮，营养状况得到改善。一般可使经济作物增产30%以上，大田作物增产7~10%或以上。
科学家通过研究发现，微生物具有把氮气固定住的神奇功能，能把空气中的自由态氮转化成作物可吸收利用的有效态氮。另外，微生物中的磷、钾细菌能分解土壤中固定的磷、钾元素，并把它们释放出来，供作物利用。那些繁殖飞快的有效菌还能刺激作物的生长，起到防病作用。于是，科学家选育出能够人工培养的有益微生物，通过工业发酵生产出微生物活体制品,可以直接用于农业生产。微生物肥料就是以微生物生命活动导致农作物得到特定的肥料效应，达到促进作物生长或产量增加或质量提高的一类制品。
另外，微生物肥料其最主要发挥作用的就是里面添加的“有益生物菌”，而应用于微生物肥料中的菌种类也分很多种，我觉得很有必要给大家普及一下！
1.枯草芽孢杆菌：增加作物抗逆性、固氮。
2.巨大芽孢杆菌：解磷(磷细菌)，具有很好的降解土壤中有机磷的功效。
3.胶冻样芽孢杆菌：解钾，释放出可溶磷钾元素及钙、硫、镁、铁、锌、钼、锰等中微量元素。
4.地衣芽孢杆菌：抗病、杀灭有害菌。
5.苏云金芽孢杆菌：杀虫(包括根结线虫)，对鳞翅目等节肢动物有特异性的毒杀活性。
6.侧孢芽孢杆菌：促根、杀菌及降解重金属。
7.胶质芽孢杆菌：有溶磷、释钾和固氮功能，分泌多种酶，增强作物对一些病害的抵抗力。
8.泾阳链霉菌：具有增强土壤肥力、刺激作物生长的能力。
9.菌根真菌：扩大根系吸收面，增加对原根毛吸收范围外的元素(特别是磷)的吸收能力。
10.棕色固氮菌：固定空气中的游离氮，增产。
11.光合菌群：是肥沃土壤和促进动植物生长的主力部队。
12.凝结芽孢杆菌：可降低环境中的氨气、硫化氢等有害气体。提高果实中氨基酸的含量。
13.米曲霉：使秸秆中的有机质成为植物生长所需的营养，提高土壤有机质，改善土壤结构。
14.淡紫拟青霉：对多种线虫都有防治效能，是防治根结线虫最有前途的生防制剂。
另外，多种复合菌相互促进、相互补充，抗土传病害效果远远大于单一菌种。有益菌群相互协同，共同作用，能使作物达到高产丰产的效果。主要体现在促进快速生长，调节生命活动，增产增收，提高品质，分解有机物质和毒素，防止重茬，保护土壤根基环境，增强作物的抗逆性。
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