为获取大棚生产的高效益，菜农大量投入化肥，由于温室无流失条件，未被吸收的各种残留态肥料成份在土壤中常年聚积，土壤盐渍化现象有逐年加重趋势，导致蔬菜不同程度地出现盐分浓度危害、蔬菜品质下降，同时还会造成土壤板结，通气和透气能力降低，栽植的蔬菜秧苗缓苗慢，易发生烂根和枯萎病等。造成大棚内土壤盐渍化的原因有以下几点：
病因之一：大量化肥 盐分残留累积：菜农为保证蔬菜养分供应，大量使用无机肥，致使用肥量过大，土壤全盐含量增加，特别是化肥施用量过大，由于灌水次数频繁，使土壤的团粒结构遭到破坏，大孔隙减少，通透性变差，土壤表层积聚了大量的盐分，更容易造成大棚土壤盐渍化、板结，使大棚土壤通透性下降。
病因之二：生施人畜粪尿 由于大棚的温度高，人畜粪尿迅速挥发分解后，大量的氨被挥发掉，使一些硫化物、硫酸盐、有机盐和无机盐残留于耕层土壤内，造成大棚土壤板结，盐渍化。同时，菜农认为有机肥富含有机质，对改良土壤，促进土壤团粒结构的形成有明显的效果，于是就大量的使用，但是一些盐分含量很高的有机肥过量施用也会造成土壤盐渍化。
针对上面的病因，从以下几个方面防治土壤盐渍化：措施一
减少化肥用量，合理使用化肥。该法可以从“源头”上控制土壤盐渍化的加剧，减轻土壤盐渍化并不等于不施化肥，而是要科学地、合理地施用。施用化肥要根据大棚土壤养分测定结果和不同作物的需肥规律，本着平衡施肥的原则，缺啥补啥，缺多少补多少，在追肥时应选择中性肥料和复合肥料，不需施入新鲜人粪尿，追肥后应及时覆土或浇小水。
措施二
土壤深耕培肥和秸秆还田。盐害发生严重的土层，多表现为板结、透气性差等特点，生产中，通过深翻土壤，打破土层结构，将上层全盐含量较高的表土翻到底层，可降低土壤盐渍化程度。深耕并掺入适量砂土，可降低地下水位，减少土壤盐渍化发生的几率。在秧苗种植或移栽时亩施腐熟优质农家肥4000公斤，可提高土质有机质的含量，改善土壤理化性状。作物秸秆直接还田后，其腐解过程中可吸附利用土壤中的矿质元素，同时还能增加土壤有机质，改善土壤透气性。
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